乳腺活检与乳房切除标本采集JoVE方法
来源身份、用途和证据角色
- 原文题名:Optimization of Breast Biopsy and Mastectomy Sample Collection Procedures for Biobanking, Personalized Medicine, and Research Applications。
- Sajo, Ma Easter Joy V.; Aquino, Lizzie Anne C. 等;两人为共同第一作者,通讯作者为 Ma Easter Joy V. Sajo。JoVE,2025-09-02,223,e67193;DOI:10.3791/67193。以上来自 PDF 第 1 页,非由文件名推断;PMID 未核验。
- 18 页英文方法文章。用途是乳腺活检与切除标本的采集、病理配对、RNA 分析/生物样本库/类器官研究分流;按 experimental-skill 摄取,不分配 P 编号。
- 属已发表原始 protocol 及其实施结果;不是本实验室的已验证 SOP、培训记录或临床效用证据。第 3 页提及此前项目已验证的 SOP 框架,不能转移为本地人工核验状态。
- 本轮完整读取 18 页正文、参考文献,目视核对 Figures 1–6,放大核对 Figures 2–3。Tables 1–2 在本 PDF 中只有题注及下载链接,没有数据表本体;未获取视频、另附材料表或表格附件。
来源明确报告
研究与协作背景
前瞻性观察 100 名不同分期的菲律宾乳腺癌患者,由 PGH、PGC、UPD-IB 协作(第 1–3 页)。作者报告注册号 RGAO-2020-0933、伦理号 UPMREB 2020-822-01;这些仅属于原研究。研究包括去标识化标本和临床病理/治疗/结局数据,参与者可退出而不影响医疗。具体纳排条件见第 3–4 页,不能直接作为本地招募标准。
流程和操作信息
| 环节 | 原文信息 | 定位与边界 |
|---|---|---|
| 活检标签 | GB 研究编码映射 BC 测序编码;A 为送 PGC 的肿瘤、C 为入库肿瘤、D 为正常组织 | §2.1,第 4 页;仅原研究命名规则 |
| 活检采集 | 超声引导、14 G;组织芯约 2 cm;邻近正常取材距肿瘤约 1 cm;肿瘤最多 9 芯、正常最多 3 芯 | §2.2–2.3,第 4–5 页;§2.2 总述“最多九芯”与后续肿瘤/正常分列须区别 |
| 活检分流 | 正文肿瘤 6 芯 RNA、3 芯入库;每芯优先纵向对半,困难时横断;一半配对病理 | §2.3,第 5 页;Figure 2 的 4/3/2 分配不同,见下表 |
| 防混样 | 正常与肿瘤用不同针;无法做到时原文要求正常先取;病理半芯与研究半芯同编码 | §2.3–2.4,第 5 页;不是本地操作授权 |
| 活检保存 | 2 mL 冻存管、1.25 mL RNA 稳定液;配对病理用 10% 中性缓冲福尔马林(NBF) | §2.4–2.7,第 5 页;5:1 比例的组织单位有疑点 |
| 切除标本 | 至少提前 2 天协调;切除后立即送病理取材,送达时不放福尔马林,降低冷缺血时间 | §3.2–3.5,第 5–6 页;不替代临床诊断优先原则的本地确认 |
| 切除组织分流 | 肿瘤/正常各至少一块 1×1×1 cm;研究与病理配对;肿瘤研究部分再三分用于 RNA、入库、类器官;正常研究部分二分用于 RNA、入库 | §3.6,第 6–7 页;肿瘤“半块”尺寸不自洽 |
| 切除肿瘤 RNA/入库 | 预冷 5 mL 管、2.5 mL RNA 稳定液;采集至放入保存液不超过 30 min,持续冷藏 | §3.6.1.4–5,第 6 页;正常组织的管容积/液量写法不清,不能直接套用 |
| 新鲜培养分支 | 15 mL 管、5 mL 组织保存液加 0.01 mL Primocin;不同区域研究份合并;新鲜湿冰运输,采集后 24 h 内送达 | §3.6.1.6、§4.4.1,第 6、8 页;原液浓度/具体保存液未在本地资料中确认 |
| 保存与运输 | §4.1 为 4°C 24 h→−20°C 约 2–4 h→−80°C;管盖封口、吸水材料、气泡膜、密封袋、上下凝胶冰袋、温度记录器与运输清单 | 第 7–8 页、Figure 5;不把冷冻路径套给新鲜培养分支 |
| 交接及质控 | 出发/接收时间、温度、管数、破损标本;RNA 送检前须有病理及肿瘤比例,选肿瘤含量最高块,每批不超过 40 份;每周检查数据库 | §4.2–4.5,第 7–9 页;文中无通用肿瘤百分比合格阈值 |
代表性结果及解释范围
- 第 9–10 页报告 RNA 建库失败的 2 份标本、筛选后测序质量及人员经验/流程优化的影响。Tables 1–2 原始数据缺失,不能重建失败率、逐样本 RIN 或浓度合格线。
- Figure 6C(第 15 页)显示采集 40 份、类器官建立成功 25/40、已建立类器官中药物实验成功 14/25;两个成功率的分母不同。图示为作者实施结果,不证明可用于个体临床用药决策。
- 病理配对减少但不能消除研究半块与病理半块差异;无完全无瘤正常块时,作者使用最低肿瘤比例块(第 9、17 页),不能称其为已证实正常对照。
不确定性或证据边界
| 冲突/缺口 | 具体位置 | 本次处理 |
|---|---|---|
| 活检分流不同 | §2.3 为 RNA 6 芯+入库3芯;Figure 2 为 T1–T4→PGC、T5–T7→UP-IB培养、T8–T9→入库;§4.4.1 又限培养为切除肿瘤 | 并列保留,活检培养和最终配额暂不形成执行指令 |
| 切除分块尺寸不同 | §3.6.1.2 把 1×1×1 cm 肿瘤块“二分”后写为每块1×0.5×0.5 cm;正常块写1×1×0.5 cm;Figure 3 也使用1×1×0.5 cm半块 | 不自动纠正原文;核实后才确定切分尺寸 |
| 切除分配图文不一 | §3.6 肿瘤研究半块三分,Figure 3 主要画 RNA/入库二分;Figure 4B 图注简写为冻存/培养二分 | 不凭图注覆盖正文或拼出统一流程 |
| 保存中间步骤不同 | §2.7、§3.8 为4°C 24 h后转−80°C;§4.1及Figures 2–3增加−20°C约2–4 h | 暂不确定本地采用哪个路径 |
| 比例/容积措辞有疑点 | §2.6 的5:1示例为“0.25 cm tissue”;§3.6.2.4–5正常组织的2.5 mL有管容积/液量歧义 | 不换算、不补单位、不自动沿用肿瘤参数 |
| 分期安排表述不同 | §1.1.3允许IIIA先手术或新辅助;§3.1笼统写III期完成8周期后切除 | 属研究路径差异,不形成治疗方案建议 |
| 安全与产品信息缺失 | 仅声明遵守机构伦理/生物安全要求;缺完整PPE、暴露/泄漏预案、产品批号/说明书、固定时长、冷链验收范围 | 留在草稿停止条件和未确认参数中 |
Wiki 跨来源综合
与 2026-09-18 样本收集流程PRL整理本地资料 的共同主题只是乳腺标本采集。尚无引用链、作者说明或版本记录证明两者的派生/独立关系;分别保存来源身份,不合并,不把 DOC 计为第二篇独立科学证据。DOC 的 ≥70%、2 h、15 min 等不补入本方法。
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- 已检索全部 46 份既有来源及候选清单;零散“类器官”模型提及不等于该采样 protocol 的独立验证。本次无新实体/概念/对比晋升。
草稿及人工问题
已建立 乳腺活检与切除标本采集及分流草稿。问题:图文分流哪个是最终版?本地试剂、病理留样及冷链条件能否覆盖?谁负责授权、异常处置与签字?暂无人工审核记录。