原始资料:生物样本库、个性化医疗和研究应用的乳腺活检和乳房切除术样本采集程序的优化.pdf

乳腺活检与乳房切除标本采集JoVE方法

来源身份、用途和证据角色

  • 原文题名:Optimization of Breast Biopsy and Mastectomy Sample Collection Procedures for Biobanking, Personalized Medicine, and Research Applications。
  • Sajo, Ma Easter Joy V.; Aquino, Lizzie Anne C. 等;两人为共同第一作者,通讯作者为 Ma Easter Joy V. Sajo。JoVE,2025-09-02,223,e67193;DOI:10.3791/67193。以上来自 PDF 第 1 页,非由文件名推断;PMID 未核验。
  • 18 页英文方法文章。用途是乳腺活检与切除标本的采集、病理配对、RNA 分析/生物样本库/类器官研究分流;按 experimental-skill 摄取,不分配 P 编号。
  • 属已发表原始 protocol 及其实施结果;不是本实验室的已验证 SOP、培训记录或临床效用证据。第 3 页提及此前项目已验证的 SOP 框架,不能转移为本地人工核验状态。
  • 本轮完整读取 18 页正文、参考文献,目视核对 Figures 1–6,放大核对 Figures 2–3。Tables 1–2 在本 PDF 中只有题注及下载链接,没有数据表本体;未获取视频、另附材料表或表格附件。

来源明确报告

研究与协作背景

前瞻性观察 100 名不同分期的菲律宾乳腺癌患者,由 PGH、PGC、UPD-IB 协作(第 1–3 页)。作者报告注册号 RGAO-2020-0933、伦理号 UPMREB 2020-822-01;这些仅属于原研究。研究包括去标识化标本和临床病理/治疗/结局数据,参与者可退出而不影响医疗。具体纳排条件见第 3–4 页,不能直接作为本地招募标准。

流程和操作信息

环节原文信息定位与边界
活检标签GB 研究编码映射 BC 测序编码;A 为送 PGC 的肿瘤、C 为入库肿瘤、D 为正常组织§2.1,第 4 页;仅原研究命名规则
活检采集超声引导、14 G;组织芯约 2 cm;邻近正常取材距肿瘤约 1 cm;肿瘤最多 9 芯、正常最多 3 芯§2.2–2.3,第 4–5 页;§2.2 总述“最多九芯”与后续肿瘤/正常分列须区别
活检分流正文肿瘤 6 芯 RNA、3 芯入库;每芯优先纵向对半,困难时横断;一半配对病理§2.3,第 5 页;Figure 2 的 4/3/2 分配不同,见下表
防混样正常与肿瘤用不同针;无法做到时原文要求正常先取;病理半芯与研究半芯同编码§2.3–2.4,第 5 页;不是本地操作授权
活检保存2 mL 冻存管、1.25 mL RNA 稳定液;配对病理用 10% 中性缓冲福尔马林(NBF)§2.4–2.7,第 5 页;5:1 比例的组织单位有疑点
切除标本至少提前 2 天协调;切除后立即送病理取材,送达时不放福尔马林,降低冷缺血时间§3.2–3.5,第 5–6 页;不替代临床诊断优先原则的本地确认
切除组织分流肿瘤/正常各至少一块 1×1×1 cm;研究与病理配对;肿瘤研究部分再三分用于 RNA、入库、类器官;正常研究部分二分用于 RNA、入库§3.6,第 6–7 页;肿瘤“半块”尺寸不自洽
切除肿瘤 RNA/入库预冷 5 mL 管、2.5 mL RNA 稳定液;采集至放入保存液不超过 30 min,持续冷藏§3.6.1.4–5,第 6 页;正常组织的管容积/液量写法不清,不能直接套用
新鲜培养分支15 mL 管、5 mL 组织保存液加 0.01 mL Primocin;不同区域研究份合并;新鲜湿冰运输,采集后 24 h 内送达§3.6.1.6、§4.4.1,第 6、8 页;原液浓度/具体保存液未在本地资料中确认
保存与运输§4.1 为 4°C 24 h→−20°C 约 2–4 h→−80°C;管盖封口、吸水材料、气泡膜、密封袋、上下凝胶冰袋、温度记录器与运输清单第 7–8 页、Figure 5;不把冷冻路径套给新鲜培养分支
交接及质控出发/接收时间、温度、管数、破损标本;RNA 送检前须有病理及肿瘤比例,选肿瘤含量最高块,每批不超过 40 份;每周检查数据库§4.2–4.5,第 7–9 页;文中无通用肿瘤百分比合格阈值

代表性结果及解释范围

  • 第 9–10 页报告 RNA 建库失败的 2 份标本、筛选后测序质量及人员经验/流程优化的影响。Tables 1–2 原始数据缺失,不能重建失败率、逐样本 RIN 或浓度合格线。
  • Figure 6C(第 15 页)显示采集 40 份、类器官建立成功 25/40、已建立类器官中药物实验成功 14/25;两个成功率的分母不同。图示为作者实施结果,不证明可用于个体临床用药决策。
  • 病理配对减少但不能消除研究半块与病理半块差异;无完全无瘤正常块时,作者使用最低肿瘤比例块(第 9、17 页),不能称其为已证实正常对照。

不确定性或证据边界

冲突/缺口具体位置本次处理
活检分流不同§2.3 为 RNA 6 芯+入库3芯;Figure 2 为 T1–T4→PGC、T5–T7→UP-IB培养、T8–T9→入库;§4.4.1 又限培养为切除肿瘤并列保留,活检培养和最终配额暂不形成执行指令
切除分块尺寸不同§3.6.1.2 把 1×1×1 cm 肿瘤块“二分”后写为每块1×0.5×0.5 cm;正常块写1×1×0.5 cm;Figure 3 也使用1×1×0.5 cm半块不自动纠正原文;核实后才确定切分尺寸
切除分配图文不一§3.6 肿瘤研究半块三分,Figure 3 主要画 RNA/入库二分;Figure 4B 图注简写为冻存/培养二分不凭图注覆盖正文或拼出统一流程
保存中间步骤不同§2.7、§3.8 为4°C 24 h后转−80°C;§4.1及Figures 2–3增加−20°C约2–4 h暂不确定本地采用哪个路径
比例/容积措辞有疑点§2.6 的5:1示例为“0.25 cm tissue”;§3.6.2.4–5正常组织的2.5 mL有管容积/液量歧义不换算、不补单位、不自动沿用肿瘤参数
分期安排表述不同§1.1.3允许IIIA先手术或新辅助;§3.1笼统写III期完成8周期后切除属研究路径差异,不形成治疗方案建议
安全与产品信息缺失仅声明遵守机构伦理/生物安全要求;缺完整PPE、暴露/泄漏预案、产品批号/说明书、固定时长、冷链验收范围留在草稿停止条件和未确认参数中

Wiki 跨来源综合

与 2026-09-18 样本收集流程PRL整理本地资料 的共同主题只是乳腺标本采集。尚无引用链、作者说明或版本记录证明两者的派生/独立关系;分别保存来源身份,不合并,不把 DOC 计为第二篇独立科学证据。DOC 的 ≥70%、2 h、15 min 等不补入本方法。

  • 已有规范实体:乳腺癌,新增采样方法导航,不增加治疗疗效主张。
  • 概念候选(纯文本):乳腺组织生物样本库采集与病理配对;乳腺标本采集冷缺血控制。
  • 已检索全部 46 份既有来源及候选清单;零散“类器官”模型提及不等于该采样 protocol 的独立验证。本次无新实体/概念/对比晋升。

草稿及人工问题

已建立 乳腺活检与切除标本采集及分流草稿。问题:图文分流哪个是最终版?本地试剂、病理留样及冷链条件能否覆盖?谁负责授权、异常处置与签字?暂无人工审核记录。